1. Luchtkwaliteit: Vanwege de kleine ruimte van het capsulehotel is ventilatie niet eenvoudig, wat gemakkelijk kan leiden tot een afname van de luchtkwaliteit, waardoor de levensveiligheid en gezondheidsrisico's van passagiers toenemen.
2. Privacyproblemen: aangezien het capsulehotel per persoon is, kunnen er beveiligings- en privacyproblemen optreden.
3. Faciliteiten en uitrusting: Het gebruik van capsulehotels is erg klein, en om de ruimte te verminderen zijn sommige faciliteiten en uitrusting te vereenvoudigd, wat mogelijk niet aan de behoeften van reizigers voldoet.